办公室 地址：西院医院4楼 电话\传真：87664126
余区分院办公室 地址：余区分院3楼 电话：86534520
校医疗费管理办公室（大学生医疗保险办公室）地址：第二行政楼2楼 电话：87855389
医务科 地址：西院医院4楼 电话：87688031
东院办公室（信息科） 地址：东院医院4楼 电话：87858865
计生办
（马区） 地址：东院医院2楼 电话：87668460
（余区） 地址：余区分院3楼 电话：86855828
财务室 地址：西院医院4楼 电话：87651306
（马区体检办公室） 地址：东院医院2楼 电话：87668460
（马区计免室、儿童和妇女保健室） 地址：东院医院3楼 电话：87850906
（余区公卫、体检办公室、计免室） 地址：余区分院3楼 电话：86534497
急诊室
（西院） 地址：西院医院2楼 电话：87860274
（余区） 地址：余区医院1楼 电话：86577120
南湖医务室 地址：大学生创业园 电话：62436140
三层楼医务室 地址：三层楼校区 电话：86702360
医院内设机构工作职责：
办公室：负责综合协调医院基层党建、党风廉政、机关作风、师德医风、统战工会、宣传与网络、安全稳定与保密工作。负责考核聘任、劳动用工、人事薪资工作。负责内外接待、会议组织、文书起草、内务管理、国有资产工作。督促协调学校与医院决议与安排的落实。
余家头分院办公室：负责余区分院办公室日常工作和来信来访及对外联系、会务与接待工作。负责余区固定资产管理工作。负责余区人员的考勤，及人员酬金发放制表工作。负责余区的内务管理和文件资料归档工作。完成领导交办的其他任务。
医务科：负责全院的医疗、护理、院感防控、教学、科研、医保等工作的具体组织和实施。对全院医疗业务、医疗质量、医疗技术实施科学的组织管理，检查、督促医疗卫生政策及各项规章制度的落实和实施，并将实施情况及时反馈给医院，以保障全院医疗工作的正常运行。
公卫科：负责全院公共卫生工作，包括居民健康档案管理、健康体检、健康教育、预防接种、重点人群健康管理，传染病及突发公共卫生事件报告和处理，卫生计生监督协管等，保障学校公共卫生安全。
财务室：负责学校医疗经费预算编制。职工、学生医疗费用的报销。学生基本医疗保险赔款的支付及商业保险资料的收取。医院各项收入及成本费用的核算。社区公卫收入及支出的核算。医院与药品供销商等往来单位债权、债务的清理与核对。